Самый воинствующий персонаж селения Листвы, для достижения цели готов использовать любые, даже жестокие, методы. В прошлом соперничал с Сарутоби за пост третьего хокагэ, поэтому считается, что он прекрасный боец. Основал и возглавил отдел обучения подразделения АНБУ, известного как «Корень» (яп. 根, Нэ). Именно он порекомендовал Сая как третьего члена в команду Какаши. Также Данзо — один из четырёх человек (наряду со старейшинами Конохи, Хомурой Митокадо и Кохару Утатанэ, а также третьим хокагэ Хирузэном Сарутоби), изначально знавших правду об Итачи Учихе.Несмотря на видимую поддержку хокагэ селения Листвы, Цунадэ не доверяла ему; причина этому — поручение Саю секретной миссии, для которой Данзо отправляет парня к Орочимару с личными делами всех членов АНБУ.Во время атаки Пейна на Коноху он убивает жабу, которую Цунадэ послала за Наруто Узумаки на гору Мёбоку, тем самым лишив Коноху возможности получить своевременную помощь от Узумаки. После того, как Пейн был ликвидирован, он высказался против кандидатуры Какаши Хатакэ на пост шестого хокагэ. Выступив с резкой критикой политики Сарутоби, завоевал лояльность лорда страны Огня (возможно, он управлял им с помощью своего сярингана), и сам стал исполнять обязанности хокагэ (для официального вступления в должность он должен был пройти и через Совет дзёнинов). После этого дал разрешение устранить Саскэ Учиху как беглого синоби, а также поручил разыскать Анко Митараши и Кабуто, так как считал, что они могут знать то, что может его скомпрометировать.Отправляется на Совет пяти кагэ в качестве шестого хокагэ, где его почти выбирают председателем альянса пяти деревень ниндзя, цель которого — борьба с Акацуки. Однако Ао, один из членов делегаций, с помощью бъякугана узнаёт в чакре Данзо чакру Шисуи Учихи и понимает, что Данзо незаконным путём заполучил его сяринган. Воспользовавшись атакой Саскэ на Совет, он сбегает и лишается доверия остальных Кагэ. Казэкагэ Гаара считает, и трое других Кагэ с ним соглашаются, что Данзо дискредитировал себя, и они готовы вести дела с Какаши Хатакэ в качестве шестого хокагэ. Тоби, стоявший за атакой на Совет кагэ, использует свой сяринган и сталкивает Саскэ и Данзо лицом к лицу. В результате начавшегося боя выясняется, что рука Данзо закована в железо и запечатана, а под ней находится сразу десять имплантированных сяринганов. В ходе битвы он использует древесные техники первого хокагэ Хаширама Сэнджу, что, по мнению Тоби, является результатом работы Орочимару над Данзо. Однако в итоге, израсходовав все возможности использования Изанаги, погибает, взрывая себя, безуспешно надеясь задеть и запечатать в свой труп Саскэ.
