Ученик старшей школы. В последний день летних каникул «Пространственный разлом» уничтожил часть его родного города. Понимая, что его сестра находится в самом центре «разлома», он спешит убедиться, что с ней всё в порядке. Однако вместо сестры в эпицентре выброса он встретил таинственную девушку в доспехах. Не успел он очнуться от произошедшего, как очутился на борту корабля «Фраксинус» организации «Рататоск», где его младшая сестра Котори оказалась начальницей. Ему объяснили, что та девушка в доспехах — «дух», и единственный способ остановить разрушения, учинённые ею, это заставить её влюбиться в Землю и её обитателей. И в роли её возлюбленного должен выступить как раз Шидо.Благодаря силе Котори, которую он запечатал пять лет назад, он может излечивать любые раны. Тридцать лет назад Синдзи Такамия встретил обнаженную девушку, сбежавшую от DEM, привел её домой и назвал Мио Такамия. Позднее они были обнаружены DEM, и пустились в бега. Однако уйти им не удаётся, а Синдзи наносит смертельную рану Айзек Уэсткотт. Обладающая способностью к исцелению Мио Такамия оказывается бессильна его исцелить. Тогда Мио попыталась воскресить Синдзи, но из-за слабости своего человеческого тела не смогла. Она воскресила уже Шидо без воспоминаний и с силой запечатывать духов.